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7449026215-Feb-2016 Ben Matthews <ben@kc2vjw.com>

various utils: include unistd.h for fork() and friends (for debugging)


phasta.cc
/phasta/M2N/src/phasta.cc
/phasta/M2NFixBnd/src/phasta.cc
50b3ba2e15-Feb-2016 Benjamin Matthews <ben@kc2vjw.com>

AcuStat: remove unneeded magic for chdir on old intel compilers


phasta.cc
358c77e915-Feb-2016 Benjamin Matthews <ben@kc2vjw.com>

AcuStat: reorder includes


phasta.cc
/phasta/CMakeFiles/FindPETSC.cmake
/phasta/CMakeLists.txt
/phasta/README.md
/phasta/checkphasta/checkphasta.cpp
/phasta/phSolver/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/common/BCprofile2.f
/phasta/phSolver/common/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/common/INIprofile.f
/phasta/phSolver/common/Makefile
/phasta/phSolver/common/auxmpi.h
/phasta/phSolver/common/blowerControl.f90
/phasta/phSolver/common/common.h
/phasta/phSolver/common/common_c.h
/phasta/phSolver/common/commu.f
/phasta/phSolver/common/commuInt.f
/phasta/phSolver/common/ctypes.f
/phasta/phSolver/common/cycle_count.c
/phasta/phSolver/common/d2wall.c
/phasta/phSolver/common/dumbCvariables.c
/phasta/phSolver/common/errorsmooth.f
/phasta/phSolver/common/fillsparse.c
/phasta/phSolver/common/fillsparse.f
/phasta/phSolver/common/findTurbWall.f
/phasta/phSolver/common/findWallNorm.f90
/phasta/phSolver/common/findslpw.f
/phasta/phSolver/common/fncorp.f
/phasta/phSolver/common/gen_ncorp.c
/phasta/phSolver/common/genbc.f
/phasta/phSolver/common/genblk.f
/phasta/phSolver/common/gendat.f
/phasta/phSolver/common/genini.f
/phasta/phSolver/common/gensav.f
/phasta/phSolver/common/get_time.c
/phasta/phSolver/common/gtnods.c
/phasta/phSolver/common/input.config
/phasta/phSolver/common/input.f
/phasta/phSolver/common/input_fform.cc
/phasta/phSolver/common/missing_win32.c
/phasta/phSolver/common/mod_BCsfIDmap.f
/phasta/phSolver/common/mod_blowing_Duct.f
/phasta/phSolver/common/mod_wallData.f90
/phasta/phSolver/common/new_interface.c
/phasta/phSolver/common/new_interface.h
/phasta/phSolver/common/phString.h
/phasta/phSolver/common/phasta.cc
/phasta/phSolver/common/phio_posix.cc
/phasta/phSolver/common/phio_posix.h
/phasta/phSolver/common/pointer.f
/phasta/phSolver/common/proces.f
/phasta/phSolver/common/readnblk.f
/phasta/phSolver/common/setBlowing_Duct.f
/phasta/phSolver/common/setBlowing_Duct3.f
/phasta/phSolver/common/setSuction_Duct3.f90
/phasta/phSolver/common/sfID2np.f
/phasta/phSolver/common/slpwBC.f
/phasta/phSolver/common/streamio.cc
/phasta/phSolver/common/symline.c
/phasta/phSolver/common/symquadw.c
/phasta/phSolver/common/symtripyr.c
/phasta/phSolver/common/test/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/common/test/phIOposixMultiTopo.cc
/phasta/phSolver/common/test/phIOreadIlwork.cc
/phasta/phSolver/common/test/testing.cmake
/phasta/phSolver/common/tmrc.c
/phasta/phSolver/common/tmrc.h
/phasta/phSolver/common/turbsa.f
/phasta/phSolver/compressible/BCprofile.f
/phasta/phSolver/compressible/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/compressible/MachControl.f90
/phasta/phSolver/compressible/Makefile
/phasta/phSolver/compressible/asaugmr.f
/phasta/phSolver/compressible/asbmfg.f
/phasta/phSolver/compressible/asigmr.f
/phasta/phSolver/compressible/asimfg.f
/phasta/phSolver/compressible/au1mfg.f
/phasta/phSolver/compressible/au2mfg.f
/phasta/phSolver/compressible/bc3res.f
/phasta/phSolver/compressible/bflux.f
/phasta/phSolver/compressible/e3.f
/phasta/phSolver/compressible/e3b.f
/phasta/phSolver/compressible/e3bvar.f
/phasta/phSolver/compressible/e3conv.f
/phasta/phSolver/compressible/e3dc.f
/phasta/phSolver/compressible/e3eig1.f
/phasta/phSolver/compressible/e3ivar.f
/phasta/phSolver/compressible/e3juel.f
/phasta/phSolver/compressible/e3mtrx.f
/phasta/phSolver/compressible/e3source.f
/phasta/phSolver/compressible/e3tau.f
/phasta/phSolver/compressible/e3visc.f
/phasta/phSolver/compressible/e3wmlt.f
/phasta/phSolver/compressible/elmgmr.f
/phasta/phSolver/compressible/elmgmrpetsc.f
/phasta/phSolver/compressible/getdiff.f
/phasta/phSolver/compressible/getthm.f
/phasta/phSolver/compressible/i3ldu.f
/phasta/phSolver/compressible/i3lu.f
/phasta/phSolver/compressible/i3pre.f
/phasta/phSolver/compressible/itrdrv.f
/phasta/phSolver/compressible/itrfdi.f
/phasta/phSolver/compressible/itrpr1.f
/phasta/phSolver/compressible/itrres.f
/phasta/phSolver/compressible/localt.f
/phasta/phSolver/compressible/mod_timedata.f90
/phasta/phSolver/compressible/npSucPatch.f
/phasta/phSolver/compressible/rstat.f
/phasta/phSolver/compressible/rstatCheck.f
/phasta/phSolver/compressible/setBlowing_Duct2.f
/phasta/phSolver/compressible/solgmr.f
/phasta/phSolver/compressible/solgmrpetsc.c
/phasta/phSolver/compressible/solmfg.f
/phasta/phSolver/compressible/timedata.f90
/phasta/phSolver/compressible/timeseries.f
/phasta/phSolver/compressible/tnanq.f
/phasta/phSolver/compressible/vorticity.f
/phasta/phSolver/incompressible/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/incompressible/Makefile
/phasta/phSolver/incompressible/filters.f
/phasta/phSolver/incompressible/forces.f
/phasta/phSolver/incompressible/itrdrv.f
/phasta/phSolver/incompressible/lesSparse.f
/phasta/phSolver/incompressible/rstatic.f
/phasta/phSolver/incompressible/solfar.f
/phasta/phSolver/incompressible/timedata.f
/phasta/phSolver/incompressible/timeseries.f
/phasta/phastaIO/phastaIO.cc
/phasta/svLS/ADDBCMUL.f
/phasta/svLS/BC.f
/phasta/svLS/CGRAD.f
/phasta/svLS/CMakeLists.txt
/phasta/svLS/COMMU.f
/phasta/svLS/CPUT.f
/phasta/svLS/DOT.f
/phasta/svLS/GE.f
/phasta/svLS/GMRES.f
/phasta/svLS/INCOMMU.f
/phasta/svLS/LHS.f
/phasta/svLS/LS.f
/phasta/svLS/Makefile
/phasta/svLS/NORM.f
/phasta/svLS/NSSOLVER.f
/phasta/svLS/PRECOND.f
/phasta/svLS/SOLVE.f
/phasta/svLS/SPARMUL.f
/phasta/svLS/dummy_prototypes.f
/phasta/svLS/license.txt
/phasta/svLS/svLS.h
/phasta/svLS/svLS_API.h
/phasta/svLS/svLS_API_c.h
/phasta/svLS/svLS_STD.h
/phasta/svLS/svLS_STRUCT.h
/phasta/svLS/svLS_STRUCT_c.h
/phasta/svLS/svLS_c.h
/phasta/svLS/svls.pc.in
3de22adc16-Nov-2015 Cameron Smith <smithc11@rpi.edu>

fix various warnings

mhmmmm... bugs it creates, copy and paste does


dumbCvariables.c
new_interface.c
phasta.cc
/phasta/CMakeLists.txt
/phasta/License.txt
/phasta/M2NFixBnd/src/dumbCvariables.c
/phasta/M2NFixBnd/src/new_interface.c
/phasta/M2NFixBnd/src/phasta.cc
/phasta/README.md
/phasta/checkphasta/CMakeLists.txt
/phasta/checkphasta/checkphasta.cpp
/phasta/converterIO/converterN2O.cc
/phasta/converterIO/converterO2N.cc
/phasta/converterIO/create_IO_O2N_input.sh
/phasta/phSolver/AMG/ramg_tools.f
/phasta/phSolver/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/common/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/common/Cinput.cc
/phasta/phSolver/common/Input.h
/phasta/phSolver/common/ValType.cc
/phasta/phSolver/common/common.f
/phasta/phSolver/common/common.h
/phasta/phSolver/common/common_c.h
/phasta/phSolver/common/ctypes.f
/phasta/phSolver/common/d2wall.c
/phasta/phSolver/common/dtn.f
/phasta/phSolver/common/dumbCvariables.c
/phasta/phSolver/common/genbc.f
/phasta/phSolver/common/genbkb.f
/phasta/phSolver/common/genblk.f
/phasta/phSolver/common/getIntPnts.c
/phasta/phSolver/common/gltri.c
/phasta/phSolver/common/input.config
/phasta/phSolver/common/input_fform.cc
/phasta/phSolver/common/new_interface.c
/phasta/phSolver/common/new_interface.h
/phasta/phSolver/common/newshape.cc
/phasta/phSolver/common/perprep.f
/phasta/phSolver/common/phComm.c
/phasta/phSolver/common/phComm.h
/phasta/phSolver/common/phIO.cc
/phasta/phSolver/common/phIO.f
/phasta/phSolver/common/phIO.h
/phasta/phSolver/common/phStr.f
/phasta/phSolver/common/phString.cc
/phasta/phSolver/common/phString.h
/phasta/phSolver/common/phasta.cc
/phasta/phSolver/common/phasta.h
/phasta/phSolver/common/phastaCommonConfig.cmake.in
/phasta/phSolver/common/phio_base.h
/phasta/phSolver/common/phio_posix.cc
/phasta/phSolver/common/phio_posix.h
/phasta/phSolver/common/phio_stream.cc
/phasta/phSolver/common/phio_stream.h
/phasta/phSolver/common/phio_sync.cc
/phasta/phSolver/common/phio_sync.h
/phasta/phSolver/common/phstreamEmpty/phstream.h
/phasta/phSolver/common/phstreamEmpty/phstreamEmpty.cc
/phasta/phSolver/common/posixio.cc
/phasta/phSolver/common/posixio.f
/phasta/phSolver/common/posixio.h
/phasta/phSolver/common/proces.f
/phasta/phSolver/common/pvsqbi.f
/phasta/phSolver/common/readnblk.f
/phasta/phSolver/common/rerun_check.f
/phasta/phSolver/common/setsyncioparam.cc
/phasta/phSolver/common/setsyncioparam.h
/phasta/phSolver/common/shp6w.c
/phasta/phSolver/common/shphex.c
/phasta/phSolver/common/shppyr.c
/phasta/phSolver/common/shptri.c
/phasta/phSolver/common/streamio.cc
/phasta/phSolver/common/streamio.f
/phasta/phSolver/common/streamio.h
/phasta/phSolver/common/symhex.c
/phasta/phSolver/common/symline.c
/phasta/phSolver/common/sympyr.c
/phasta/phSolver/common/symquad.c
/phasta/phSolver/common/symquadw.c
/phasta/phSolver/common/symtet.c
/phasta/phSolver/common/symtri.c
/phasta/phSolver/common/symtripyr.c
/phasta/phSolver/common/symwdg.c
/phasta/phSolver/common/syncio.cc
/phasta/phSolver/common/syncio.f
/phasta/phSolver/common/syncio.h
/phasta/phSolver/common/test/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/common/test/chdir_mod.f
/phasta/phSolver/common/test/phIOread.f
/phasta/phSolver/common/test/phIOreaddatablock.cc
/phasta/phSolver/common/test/phIOreadheader.cc
/phasta/phSolver/common/test/phIOwrite.cc
/phasta/phSolver/common/test/phIOwrite.f
/phasta/phSolver/common/test/testing.cmake
/phasta/phSolver/common/turbsa.f
/phasta/phSolver/compressible/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/compressible/main.cc
/phasta/phSolver/compressible/phastaCConfig.cmake.in
/phasta/phSolver/compressible/test/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/compressible/test/testing.cmake
/phasta/phSolver/compressible/tnanq.f
/phasta/phSolver/incompressible/BCprofile.f
/phasta/phSolver/incompressible/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/incompressible/errsmooth.f
/phasta/phSolver/incompressible/hessian.f
/phasta/phSolver/incompressible/itrdrv.f
/phasta/phSolver/incompressible/lesSparse.f
/phasta/phSolver/incompressible/main.cc
/phasta/phSolver/incompressible/phastaICConfig.cmake.in
/phasta/phSolver/incompressible/test/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/incompressible/test/testing.cmake
/phasta/phSolver/incompressible/usr.c
/phasta/phSolver/phastaConfig.cmake.in
/phasta/phastaIO/phastaIO.cc
/phasta/phastaIO/phastaIO.h
/phasta/shapeFunction/src/shapeFuncInternals.h
5959951616-Apr-2015 Kenneth E. Jansen <Kenneth.Jansen@colorado.edu>

Initial Commit


/phasta/AcuStat/AcuStat_input.dat
/phasta/AcuStat/CMakeLists.txt
/phasta/AcuStat/create_AcuStatInput.sh
/phasta/AcuStat/include/auxmpiAcuStat.h
/phasta/AcuStat/include/commonAcuStat.h
/phasta/AcuStat/include/commonAcuStat_c.h
/phasta/AcuStat/include/new_interfaceAcuStat.h
/phasta/AcuStat/include/setsyncioparamAcuStat.h
CMakeLists.txt
cname.f
commuMax.f
ctypes.f
dumbCvariables.c
error.f
input.f
main.c
new_interface.c
phasta.cc
readnblk.f
setsyncioparam.cc
tmrc.c
/phasta/CMakeFiles/FindFMDB.cmake
/phasta/CMakeFiles/FindMeshSim.cmake
/phasta/CMakeLists.txt
/phasta/M2N/CMakeLists.txt
/phasta/M2N/M2N_input.dat
/phasta/M2N/include/auxmpiM2N.h
/phasta/M2N/include/commonM2N.h
/phasta/M2N/include/commonM2N_c.h
/phasta/M2N/include/new_interfaceM2N.h
/phasta/M2N/include/setsyncioparamM2N.h
/phasta/M2N/src/CMakeLists.txt
/phasta/M2N/src/cname.f
/phasta/M2N/src/commu.f
/phasta/M2N/src/ctypes.f
/phasta/M2N/src/dumbCvariables.c
/phasta/M2N/src/input.f
/phasta/M2N/src/main.c
/phasta/M2N/src/new_interface.c
/phasta/M2N/src/phasta.cc
/phasta/M2N/src/readnblk.f
/phasta/M2N/src/setsyncioparam.cc
/phasta/M2NFixBnd/CMakeLists.txt
/phasta/M2NFixBnd/include/auxmpiM2NFixBnd.h
/phasta/M2NFixBnd/include/commonM2NFixBnd.h
/phasta/M2NFixBnd/include/commonM2NFixBnd_c.h
/phasta/M2NFixBnd/include/new_interfaceM2NFixBnd.h
/phasta/M2NFixBnd/include/setsyncioparamM2NFixBnd.h
/phasta/M2NFixBnd/src/CMakeLists.txt
/phasta/M2NFixBnd/src/cname.f
/phasta/M2NFixBnd/src/commuMax.f
/phasta/M2NFixBnd/src/ctypes.f
/phasta/M2NFixBnd/src/dumbCvariables.c
/phasta/M2NFixBnd/src/error.f
/phasta/M2NFixBnd/src/input.f
/phasta/M2NFixBnd/src/main.c
/phasta/M2NFixBnd/src/new_interface.c
/phasta/M2NFixBnd/src/phasta.cc
/phasta/M2NFixBnd/src/readnblk.f
/phasta/M2NFixBnd/src/setsyncioparam.cc
/phasta/M2NFixBnd/src/tmrc.c
/phasta/converterIO/.gitignore
/phasta/converterIO/CMakeLists.txt
/phasta/converterIO/Makefile
/phasta/converterIO/README.md
/phasta/converterIO/converterN2O.cc
/phasta/converterIO/converterO2N.cc
/phasta/converterIO/create_IO_N2O_input.sh
/phasta/converterIO/create_IO_O2N_input.sh
/phasta/phMetis/CMakeLists.txt
/phasta/phMetis/Lib/CMakeLists.txt
/phasta/phMetis/Lib/balance.c
/phasta/phMetis/Lib/bucketsort.c
/phasta/phMetis/Lib/ccgraph.c
/phasta/phMetis/Lib/coarsen.c
/phasta/phMetis/Lib/compress.c
/phasta/phMetis/Lib/debug.c
/phasta/phMetis/Lib/defs.h
/phasta/phMetis/Lib/estmem.c
/phasta/phMetis/Lib/fm.c
/phasta/phMetis/Lib/fortran.c
/phasta/phMetis/Lib/frename.c
/phasta/phMetis/Lib/graph.c
/phasta/phMetis/Lib/initpart.c
/phasta/phMetis/Lib/kmetis.c
/phasta/phMetis/Lib/kvmetis.c
/phasta/phMetis/Lib/kwayfm.c
/phasta/phMetis/Lib/kwayrefine.c
/phasta/phMetis/Lib/kwayvolfm.c
/phasta/phMetis/Lib/kwayvolrefine.c
/phasta/phMetis/Lib/macros.h
/phasta/phMetis/Lib/match.c
/phasta/phMetis/Lib/mbalance.c
/phasta/phMetis/Lib/mbalance2.c
/phasta/phMetis/Lib/mcoarsen.c
/phasta/phMetis/Lib/memory.c
/phasta/phMetis/Lib/mesh.c
/phasta/phMetis/Lib/meshpart.c
/phasta/phMetis/Lib/metis.h
/phasta/phMetis/Lib/mfm.c
/phasta/phMetis/Lib/mfm2.c
/phasta/phMetis/Lib/mincover.c
/phasta/phMetis/Lib/minitpart.c
/phasta/phMetis/Lib/minitpart2.c
/phasta/phMetis/Lib/mkmetis.c
/phasta/phMetis/Lib/mkwayfmh.c
/phasta/phMetis/Lib/mkwayrefine.c
/phasta/phMetis/Lib/mmatch.c
/phasta/phMetis/Lib/mmd.c
/phasta/phMetis/Lib/mpmetis.c
/phasta/phMetis/Lib/mrefine.c
/phasta/phMetis/Lib/mrefine2.c
/phasta/phMetis/Lib/mutil.c
/phasta/phMetis/Lib/myqsort.c
/phasta/phMetis/Lib/ometis.c
/phasta/phMetis/Lib/parmetis.c
/phasta/phMetis/Lib/pmetis.c
/phasta/phMetis/Lib/pqueue.c
/phasta/phMetis/Lib/proto.h
/phasta/phMetis/Lib/refine.c
/phasta/phMetis/Lib/rename.h
/phasta/phMetis/Lib/separator.c
/phasta/phMetis/Lib/sfm.c
/phasta/phMetis/Lib/srefine.c
/phasta/phMetis/Lib/stat.c
/phasta/phMetis/Lib/struct.h
/phasta/phMetis/Lib/subdomains.c
/phasta/phMetis/Lib/timing.c
/phasta/phMetis/Lib/util.c
/phasta/phMetis/Makefile
/phasta/phMetis/Makefile.am
/phasta/phMetis/VERSION
/phasta/phMetis/configure.ac
/phasta/phSolver/AMG/Makefile
/phasta/phSolver/AMG/amgread.txt
/phasta/phSolver/AMG/ramg_ITAI.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_cheby.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_coarse.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_control.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_data.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_driver.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_extract.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_ggb.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_mls.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_paratools.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_smoother.f
/phasta/phSolver/AMG/ramg_tools.f
/phasta/phSolver/CHANGES
/phasta/phSolver/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/Makefile
/phasta/phSolver/Test_C/forces.correct
/phasta/phSolver/Test_C/geom.atdb
/phasta/phSolver/Test_C/geom.bdr
/phasta/phSolver/Test_C/geom.dmg
/phasta/phSolver/Test_C/geom.sms
/phasta/phSolver/Test_C/histor.correct
/phasta/phSolver/Test_C/solver.inp
/phasta/phSolver/Test_IC/geom.atdb
/phasta/phSolver/Test_IC/geom.bdr
/phasta/phSolver/Test_IC/geom.dmg
/phasta/phSolver/Test_IC/geom.sms
/phasta/phSolver/Test_IC/histor.correct
/phasta/phSolver/Test_IC/solver.inp
/phasta/phSolver/common/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/common/Cinput.cc
/phasta/phSolver/common/GaussLegendre1D.c
/phasta/phSolver/common/GaussLegendreSimplex.c
/phasta/phSolver/common/Input.h
/phasta/phSolver/common/Makefile
/phasta/phSolver/common/ValType.cc
/phasta/phSolver/common/ValType.h
/phasta/phSolver/common/asadj.f
/phasta/phSolver/common/asbnabi.f
/phasta/phSolver/common/asbwmod.f
/phasta/phSolver/common/asithf.f
/phasta/phSolver/common/auxmpi.h
/phasta/phSolver/common/aveprep.f
/phasta/phSolver/common/bardmc.f
/phasta/phSolver/common/bctint.f
/phasta/phSolver/common/blkdta.f
/phasta/phSolver/common/clear.f
/phasta/phSolver/common/cmass.f
/phasta/phSolver/common/cname.f
/phasta/phSolver/common/common.h
/phasta/phSolver/common/common_c.h
/phasta/phSolver/common/common_c.h.orig
/phasta/phSolver/common/commu.f
/phasta/phSolver/common/ctypes.f
/phasta/phSolver/common/d2wall.c
/phasta/phSolver/common/dtn.f
/phasta/phSolver/common/dumbCvariables.c
/phasta/phSolver/common/e3metric.f
/phasta/phSolver/common/elem-search.f
/phasta/phSolver/common/elm3keps.f
/phasta/phSolver/common/eqn_plane.f
/phasta/phSolver/common/error.f
/phasta/phSolver/common/f3lhs.f
/phasta/phSolver/common/fillsparse.f
/phasta/phSolver/common/filtprep.f
/phasta/phSolver/common/findslpw.f
/phasta/phSolver/common/flush.c
/phasta/phSolver/common/genadj.f
/phasta/phSolver/common/genbc.f
/phasta/phSolver/common/genbc1.f
/phasta/phSolver/common/genbkb.f
/phasta/phSolver/common/genblk.f
/phasta/phSolver/common/gendat.f
/phasta/phSolver/common/genibc.f
/phasta/phSolver/common/genini.f
/phasta/phSolver/common/genint.f
/phasta/phSolver/common/gensav.f
/phasta/phSolver/common/genscale.f
/phasta/phSolver/common/genshp.f
/phasta/phSolver/common/genshpb.f
/phasta/phSolver/common/gensvb.f
/phasta/phSolver/common/getIntPnts.c
/phasta/phSolver/common/get_a_not_hex.f
/phasta/phSolver/common/get_coeff.f
/phasta/phSolver/common/getdmc.f
/phasta/phSolver/common/getstrl.f
/phasta/phSolver/common/gettab.f
/phasta/phSolver/common/getvel.f
/phasta/phSolver/common/gltri.c
/phasta/phSolver/common/gtnods.f
/phasta/phSolver/common/hierarchic.f
/phasta/phSolver/common/ibcupdate.f
/phasta/phSolver/common/input.config
/phasta/phSolver/common/input.f
/phasta/phSolver/common/input_fform.cc
/phasta/phSolver/common/input_fform.cc_ORIG
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/phasta/phSolver/compressible/BCprofile2.f
/phasta/phSolver/compressible/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/compressible/Makefile
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/phasta/phSolver/include/topo_shapedefs.h
/phasta/phSolver/include/usr.h
/phasta/phSolver/include/vec_func.h
/phasta/phSolver/incompressible/BCprofile.f
/phasta/phSolver/incompressible/CMakeLists.txt
/phasta/phSolver/incompressible/Makefile
/phasta/phSolver/incompressible/advLES.f
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/phasta/phSolver/incompressible/usr.h
/phasta/phSolver/incompressible/write_hessian.c
/phasta/phSolver/testIC-DSIM/geom.sdm
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/phasta/phSolver/testIC-DSIM/geom.spj
/phasta/phSolver/testIC-DSIM/solver.inp
/phasta/phastaIO/.gitignore
/phasta/phastaIO/CMakeLists.txt
/phasta/phastaIO/Makefile
/phasta/phastaIO/README
/phasta/phastaIO/phastaIO.cc
/phasta/phastaIO/phastaIO.h
/phasta/phastaIO/phiotmrc.cc
/phasta/phastaIO/phiotmrc.h
/phasta/phastaIO/rdtsc.h
/phasta/phastaIO/vtkPPhastaReader.cxx
/phasta/phastaIO/vtkPPhastaReader.h
/phasta/phastaIO/vtkPhastaReader.cxx
/phasta/phastaIO/vtkPhastaReader.h
/phasta/shapeFunction/CMakeLists.txt
/phasta/shapeFunction/Makefile
/phasta/shapeFunction/Makefile.am
/phasta/shapeFunction/configure.ac
/phasta/shapeFunction/src/Bn.c
/phasta/shapeFunction/src/BnDrv.c
/phasta/shapeFunction/src/CMakeLists.txt
/phasta/shapeFunction/src/En.c
/phasta/shapeFunction/src/EnDrv.c
/phasta/shapeFunction/src/Fn.c
/phasta/shapeFunction/src/FnDrv.c
/phasta/shapeFunction/src/Lagrange.c
/phasta/shapeFunction/src/TriShapeAndDrv.cc
/phasta/shapeFunction/src/blend.c
/phasta/shapeFunction/src/blendDrv.c
/phasta/shapeFunction/src/modeShape.c
/phasta/shapeFunction/src/modeShapeDrv.c
/phasta/shapeFunction/src/parDrv.c
/phasta/shapeFunction/src/shapeFuncInternals.h
/phasta/shapeFunction/src/uniformP.c